农业水利工程系成立于2014年，下设本科专业农业水利工程，硕士专业农业水土工程和农业工程，博士专业方向为农业水土工程。其中，农业水利工程专业始建于1952年北京水利学校的农田水利专业，1960年改名为农田水利工程专业，1978年开始招收农田水利工程硕士研究生，1997年学科调整后专业名称改为农业水利工程专业，沿用至今。专业于2010年获批国家级高等学校特色专业建设点，2013年获批国家级专业综合改革试点，2014年获批国家级卓越农林人才教育培养计划改革试点，2018年通过教育部工程教育专业认证，2019年入选首批国家级一流本科专业建设点，2020年成为河南省新工科、新农科立项建设专业。

农业水利工程系所依托的学科为国家首批授权硕士点学科（1981年），也是原水利部重点学科，2003年获得农业工程一级学科硕士学位授权，成为河南省重点学科，2013年获农业水土工程研究方向博士学位授予权。学科目前拥有“黄河流域水资源高效利用”省部共建协同创新中心1个国家级科研平台，拥有河南省节水农业重点实验室、河南省农业水资源高效利用国际联合实验室、河南省水旱灾害管理工程技术研究中心等14个省级教学科研平台。多年来，学科紧紧围绕农业工程内涵，充分发挥学校的水利特色，逐步形成了农业水土环境保护与修复工程、节水农业与水资源高效利用、农业信息化与智慧管理工程、农用动力与机械装备等4个稳定的研究方向，并在高效节水灌溉技术、智慧灌区关键技术等方面特色明显，为推动农业强国、农业强省，确保国家粮食安全做出了重要贡献。

农业水利工程系为河南省优秀基层教学组织，农水系教工支部为河南优秀基层党组织，现有专任教师42人，其中教授10人，副教授12人，博士34人，硕士5人，是一支职称、年龄、学历、学缘结构合理的高水平师资队伍。教师团队目前拥有河南省高等学校“黄大年式”教师团队1个，河南省“节水农业工程”教学团队1个，河南省科技创新团队4个、河南省教学名师2人，中原科技创新领军人才1人，河南省科技创新杰出青年1人，河南省青年骨干教师4人，河南省教学标兵1人。

目前，农水系教师主讲的《水泵与泵站A》等3门课程为国家级一流本科课程，《水利工程制图及CAD技术》等3门课程为省级一流本科课程，《环境水利学》等获批河南省研究生教育优质课程，《水利工程经济学》获批河南省规划教材；农水系青年教师获全国青年教师讲课竞赛特等奖1人，一等奖6人；农水系教师指导的大学生创新项目获得全国大学生水利创新大赛一等奖1项、二等奖3项，获全国大学生农业水利工程及相关专业创新设计大赛特等奖1项、一等奖6项。

近年来，农业水利工程系承担包括国家自然科学基金、国家重点研发计划在内70余项科研项目。开发了精量滴灌关键技术及成套产品，构建了基于大数据、物联网与人工智能的节水灌溉模式和绿色智慧灌区综合管理技术体系，完善了水气耦合高效灌溉技术及土壤重金属污染防治技术等，获得国家科技进步二等奖1项，省部级科技成果奖励31项，发表国内外高水平学术期刊论文200余篇，出版学术专著19部，授权发明专利50项，具有持续创新能力和较好的发展前景。

目前，农业水利工程系每年招收5个本科班，拥有在校生530多人，毕业生就业率在93%以上，深受用人单位欢迎。自办学以来，农业水利工程系已累计培养4000余名农业水利工程专业毕业生，人才培养数量位居全国前列，已形成了具有自身特色的高层次人才培养模式，并培养了诸如水利部部长陈雷、中国长江三峡集团有限公司董事长刘伟平等一大批杰出管理人才，以及瑞士工程科学院院士刘俊国、水利部原总规划师张志彤等为代表的杰出科学技术人才，人才培养成效十分显著。