清源书院，得名自东汉班固《泗水亭碑铭》中“源清流洁，本盛末荣”，南宋朱熹亦有名句“问渠哪得清如许，为有源头活水来”。唯有源清才能洁水流长，以灌沃蓬勃的生命；唯有源活才能清渠如许，以更新沉寂的旧貌。“修己善群，致知精进”的办院理念与院名的内涵恰切相契，同时鲜明引申出“清源学子”的人文素养为：“立身清正，怀源知恩；为学清白，穷源以致；处事清谨，澄源乃行。”

清源书院实行的书院制，既借鉴了中国现代大学书院的住宿制、导师制等主要举措，又融入了古代书院的德业兼修、因材施教、教学相长等优良传统，致力于在书院社区建立师生成长共同体，并初步形成专业教育、通识教育和实践教育相融合的育人体系。在清源书院的每位书院学生都具有双重身份，既是专业院系的学生，也是书院生活的院生。院系负责学生的专业学习与学术发展（第一课堂），书院负责第一课堂之外的学习生活与养成教育（第二课堂）。

书院与专业院系合理分工、各取所长、紧密协作，以办院理念为根本宗旨，以双院协同为育人途径，合力培养以“勤学、进取、诚毅、担当”为核心素养的青年学子。“丘山积卑而为高，江河合水而为大”，唯有勤学才能广才通识，厚积薄发，成为专业发展创新之源；“自信人生二百年，会当水击三千里”，生而逢盛世，青年当进取。关键在于辨析时事提升觉悟，激浊扬清，成为社会思想进步之源；“水利万物润无声，于名于利从不争”，少年固然怀壮志，但立身之本还在品性。唯有诚毅才能律己，敦品明理而涵养正气，这是时代青年的成长之源；“千淘万漉虽辛苦，吹尽狂沙始到金”，个人成长要历经坎坷风霜，民族复兴更还有漫漫征途，只有代代敢于担当的有志青年，知行合一，笃行致远，才能淬炼成为中华民族伟大复兴的力量之源。

书院承担着培养与提升学生素质的重要育人使命，日常管理中主要通过开展主题深刻、形式丰富的各类社会实践、朋辈交流、文艺体育等活动，引领“清源学子”成长为行业和社会中可靠、可信之才。书院内各项与育人目标及举措相配套的硬件设施、显隐文化一应俱全。