清源书院成立于2021年10月，是华北水利水电大学首批住宿制书院。书院之名，源自朱熹名句“问渠哪得清如许，为有源头活水来”，寓意学生在“学习-更新-提升”的循环中持续成长，源远流长。书院秉持“修己善群，致知精进”办学理念，自成立以来，始终以学生社区自治管理为特征，以“一站式”学生社区建设为载体，积极探索书院制人才培养模式。

书院聚焦立德树人根本任务，实行“双院协同”管理，构建了“党建引领、双院协同、三全育人、四导先行、五育并举、六维六度”育人机制，通过“三个重塑”推动管理扁平化，将书院“一站式”学生社区打造成学生成长的新场域、管理服务的新载体、“三全育人”的新平台。目前涵盖5个学院15个专业的大一学生1265人。现有常驻导师9人，全面负责书院学生管理与育人工作。下设2个党支部、41个团支部，成立山海社区、青云社区、晨曦社区、新芽社区、灵渊社区、叁号院社区等6个社区，组建水韵咖社、爱之翼、星火思启研习社、大学生辩论协会、法律援助协会等9个社团（兴趣小组），书院除配备育人导师、朋辈导师、实践导师队伍外，还聘有包含著名科幻作家刘慈欣在内的30余名校内外专家教授领衔的社会导师，逐步形成了全员、全过程、全方位服务学生成长、成才的育人群体。

书院硬件设施完善，拥有功能齐全的“一站式”服务大厅，建有红色文化基因库、学习研讨室、最强大脑俱乐部、茶艺室、运动活力空间等20余间功能齐全、满足学生素质发展多样化需求的社区功能室，成为师生共有、共建、共享的文化场所和公共空间。学生宿舍均为配备独立卫浴、空调与24小时热水的四人间，条件优越。创新开展“学·思·启”大讲堂、非遗进社区、我与书记面对面等特色活动，成立学生自我管理委员会，鼓励学生深度参与社区自治与文化建设。

书院育人成果显著，荣誉卓著。2022年获评河南省首批书院制育人模式改革示范书院，2025年，清源书院申报的高校“一站式”学生社区风采展示项目荣获河南省高校思想政治工作质量提升改革与精品建设项目，育人成果及“清源模式”经验做法获人民论坛网、中国青年网等国家级、省级媒体报道30余次，具有广泛的示范意义。